2003年：公布首批12處潛力點
為使臺灣文化資產保存理念與國際接軌，文化部（原行政院文化建設委員會）於2002年徵詢專家學者、地方政府及文史工作室提報潛力名單，並經會議審議選出11處潛力點，包括太魯閣國家公園、棲蘭山檜木林、卑南遺址與都蘭山、阿里山林業暨鐵道文化景觀、金門島與烈嶼、大屯火山群、蘭嶼聚落與自然景觀、淡水紅毛城及其週遭歷史建築群、水金九礦業遺址、澎湖玄武岩自然保留區、臺鐵舊山線。同年底邀請國際文化紀念物與歷史場所委員會（ICOMOS）副主席西村幸夫、日本ICOMOS副會長杉尾伸太郎及澳洲建築師布魯斯‧沛曼來臺現勘，並增列玉山國家公園，於2003年正式公布12處潛力點。
2009–2010年：擴增至18處潛力點
2009年成立「世界遺產推動委員會」，將原「金門島與烈嶼」與馬祖合併為「金馬戰地文化」，並增列樂生療養院、桃園臺地陂塘、烏山頭水庫與嘉南大圳、屏東排灣族石板屋聚落、澎湖石滬群等5處潛力點，合計17處（18點）。 2010年再度審議，為凸顯金門與馬祖各自的文化特色，決議將「金馬戰地文化」分為「金門戰地文化」與「馬祖戰地文化」，至此臺灣世界遺產潛力點總數達18處。